第三章:实时荧光定量PCR的应用
一、相对定量测定不同样品中基因表达量的相对值
在进行实时荧光定量PCR时,内参基因的选择至关重要,其决定着结果的有效性。以下为选择内参基因时需遵循的几个要点:
- 始终选择表达丰度高且稳定的基因作为内参基因;
- 切忌盲目选择常用的内参基因;
- 常用的内参基因包括GAPDH、Actin和Tublin。
添加内参基因后,结果的计算将更加准确。
二、绝对定量
绝对定量主要是依据标准品测定样品中基因表达量的绝对值(拷贝数)。标准品可包括:
- A/克隆质粒;
- B/PCR产物;
- C/cDNA(需要注意的是,扩增效率测定时无法用于绝对定量)。
拷贝数的计算可以通过以下公式进行:
平均分子量(MW)计算如下:
- dsDNA = (碱基数) × (660道尔顿/碱基);
- ssDNA = (碱基数) × (330道尔顿/碱基);
- ssRNA = (碱基数) × (340道尔顿/碱基)。
拷贝数计算公式为:
(6.02 × 10²³ 拷贝数/摩尔) × (浓度 g/ml) / (MW g/mol) = copies/ml。
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